Denna kurs hålls till stor del som lärarledda övningar. Kursen ger erfarenhet och kunskap i programmering i allmänhet och i Python i synnerhet. Fokus är speciellt på bioinformatiska tillämpningar. Arbetet sker i Linux-miljö och kursen kommer utveckla studentens kunskaper inte bara i Python men också i Bash (kommandoskal) och CGI (Common Gateway Interface).This hands on course will give you experience and knowledge of programming in general and in Python  in particular. The focus is especially on applications in bioinformatics. Working environment is Linux and the course will develop the students’ skills in Python but also in Bash and CGI (Common Gateway Interface).    

Kursen primära syfte är att studenterna ska förvärva djupare insikter om och färdigheter i grundläggande koncept och verktyg för jämförande sekvensanalys, inkluderande olika typer av primära och sekundära sekvensdatabaser. Kursen ingår i masterprogrammet i Bioinformatik Kursen BINP17 kan läsas i kombination med kursen BINP16 Programmering i Python7.5 hp och ingår i masterprogrammet i bioinformatikBioinformatics, the application of computational methods to biological and biomedical problems, is a rapidly growing field. Modern biochemists and biologists need to have a basic knowledge of bioinformatics. This course provides both a practical and a theoretical overview of database searching, sequence alignment, phylogenetic analysis, gene prediction and genome analysis. BINP17 can be taken eith

I kursen ingår sammanfogning av genom-, transkriptom- och amplikondata samt en första analys av resultaten i form av genprediktion (för genom), samt expressionsanalys (för transkriptom). Gener och transkript annoteras på en grundläggande nivå. Studenterna genomför flera övningar i hur kommandoskal fungerar samt ett flertal programmeringsuppgifter i Python. Under kursen genomförs en individuell proThis hands on course will give you the experience and provide the tools that are needed to analyze next generation sequencing data. It is particularly focused on the analysis of: transcriptome data amplicon data genome data Working environment is Linux and the course will develop the students’ skills in Bash and Python. Covered areas are: assemblies differential expression varia

Efter assemblering av data, genererade med nya sekvenseringsmetoder såsom ”next generation sequencing”, måste resultatet knytas till den bakomliggande biologiska frågeställningen. Det innebär att den fortsatta analysen kommer att kräva olika bioinformatiska metoder. Kursen ger exempel på ett stort antal bioinformatiska tillämpningar för att besvara olika frågeställningar, t.ex. klassificering av gAfter assembling of data, generated by new sequencing methods such as "next generation sequencing", the results must be linked to the underlying biological questions. It implies that the subsequent analysis will require different bioinformatics methods. The course gives example of a large number of bioinformatics applications to answer different issues e.g. classification of genetic variants ("var

Kursen omfattar planering, genomförande och redovisning av en del av ett forskningsprojekt. Projektet ska ha anknytning till bioinformatisk utbildning. Kursen ingår i Masterprogrammet i BioinformatikIn this courses, you learn how to plan and carry out a project in Bioinformatics from start to end. The course is open for students on the Master's programme in Bioinformatics  

Kursens övergripande mål är att den studerande med stor självständighet skall genomföra ett vetenskapligt projekt inom ett väl definierat bioinformatiskt ämnesområde. Vi erbjuder masterexamensarbete i bioinformatik omfattande 30, 45 eller 60 högskolepoängYou can perform a Master's Degree project of 30 (BINP50), 45 (BINP51) or 60 (BINP52) credits in Bioinformatics. To be able to apply for a Master´s Degree Project in Bioinformatics you should be enrolled in the Masters Program in Bioinformatics at Lund University, and should have completed 45 credits of relevant advanced level courses within the programme.  

Kursens övergripande mål är att den studerande med stor självständighet skall genomföra ett vetenskapligt projekt inom ett väl definierat biologiskt ämnesområde. Du kan göra ett masterexamensarbete i biologi omfattande 30, 45 eller 60 högskolepoäng.You can perform a Master's Degree project of 30, 45 or 60 credits in either General Biology, or one of the specializations Animal Ecology, Aquatic Ecology, Conservation Biology or Plant Science. To be able to do a Master´s Degree Project in Biology you should be enrolled in the Master´s Program in Biology at Lund University, and should have completed 45 credits of relevant advanced level courses

Mikroberna är jordens osynliga majoritet. De finns i stort sett överallt där vi hittar flytande vatten och deras aktiviteter påverkar starkt alla andra livsformer. Vilken del av biologin du än specialiserar dig mot är kunskaper om mikroorganismerna viktiga. Deras betydelse inom t.ex. medicin, livsmedelsindustri, bioteknik och som molekylärbiologiska modellorganismer är välkänd, men mikrobiologin hMicrobes are the unseen majority on earth. They are found essentially everywhere where there is liquid water and their activities strongly affect all other forms of life. Whatever part of biology you are specialising in, knowledge about microorganisms is valuable. Their importance in e.g. medicine, food industry, biotechnology, and as model organisms in molecular biology is well known, but microbi

Kursen ger inblick i sinnenas funktion och betydelse för djurens beteenden samt exemplifierar djurens kommunikation. Kursen behandlar syn och annan ljusreception; lukt; smak; hörsel; balanssinne; mekanoreception; elektroreception; magnetoreception samt sinnen för temperatur och infraröd strålning. Samtliga sinnen studeras jämförande över djurriket.The course deals with vision and other types of photoreception, olfaction, taste, hearing, equilibrium, mechanoreception, pressure reception, electroreception, magnetoreception and senses for temperature and heat radiation. All senses are studied comparatively across the animal kingdom. A range of methods in physiology, ethology and human psychophysics are taught and used during the course.

Kursen fokuserar på att du skall lära dig grundläggande teori och förståelse för de viktigaste molekylära genetiska metoderna som används i moderna ekologiska och evolutionära forskningsprojekt. Centralt är att förstå betydelsen av genetisk variation för artbildning, populationsdifferentiering och individers anpassningar till olika miljöer, så som adaptationer mellan värd och parasit. Efter kursenIn this course you will learning basic theory and understanding of the most important molecular genetic methods used in modern ecological and evolutionary research projects. Central is to understand the importance of genetic variation for speciation, population differentiation and adaptations of individuals to different environments, for example adaptations between hosts and their parasites. After

Kursen är en avancerad kurs i Ekologi och kan ses som en del i en utbildning inom naturvård. Övergripande målsättning för kursen är att studenterna ska lära sig att med minimal tid i fält skaffa sig maximal kunskap om naturen med utgångspunkt i vad det insamlade materialet skall användas till. Övervakning av naturen innebär i sin strängaste betydelse att undersökaren vet vilken förändring som kan The main objective of this course is that you learn to optimise time in the field in order to obtain maximum information about the conditions and status of the natural environment. Monitoring of nature is based on that the investigator knows what change is expected and can construct a programme, including collection of data and material, which can detect a particular change. You may also do a gene

Kursen har som mål att ge kännedom om ekotoxikologiska teorier, modeller, problemställningar och arbetsmetoder. Vi behandlar teorier och modeller rörande toxikologiska testmetoder och endpoints, fördelnings-, spridnings-, och fugacitetskoncept, bioackumulering och biomagnifiering. Ekotoxikologiska effekter studeras på olika organisationsnivåer, biokemisk-fysiologisk, cell, organism, populatioThis course is aiming to provide understanding and practical knowledge of the fate, uptake and effects of anthropogenic pollutants in the environment. We study and apply ecotoxicological theories, models, and common methods and approaches concerning: fate of pollutants in the environment using fugacity based multimedia partitioning models; uptake and accumulation using models of bioconcentration a

Kursen är en avancerad kurs i ekologi och fokuserar på artkunskap, metodik och grundläggande ekologi om fåglar. Kursen bygger på lärande av metoder för att studera fåglar i fält, fältbestämning av fåglar (med avseende på igenkänning av arter mha utseende och sång) samt teori om fåglars morfologiska, fysiologiska och ekologiska anpassningar. Mer specifikt innebär fältstudierna att du lär dig grundeThis is an advanced course in ecology that focuses on species identification, methodology and basic ecology about birds. The course is based on learning the basic skills about techniques for studying birds in the field (including visual identification and identification on vocalizations), as well as theoretical moments about bird morphology, physiology and ecological adaptations. More specifically

Kursen är en avancerad kurs i ekologi och beskriver hur man tillämpar de ekotoxikologiska teorierna som inhämtats på kursern BIOR41, Ekotoxikologi i yrkes- och forskningsverksamhet. Övergripande mål är att förstå och identifiera ekotoxikologins roll i samhället och att träna på att använda sina ekotoxikologiska kunskaper för att lösa samhällsproblem orsakade av kemikalieanvändning. Kursen består aThis course is an advanced course in biology aiming to provide understanding and practical knowledge of how ecotoxicological theories and models are applied and implemented by different stakeholders in society, mainly outside academia. An overall aim is to identify the role of ecotoxicology in society and to practice use of your knowledge of ecotoxicology to resolve issues or problems caused by th

Antibiotika är mycket viktiga substanser. Merparten av alla kända antibiotika kommer från bakterier. Antibiotika har betraktats som nästan perfekta läkemedel men användningen begränsas genom att bakterier utvecklar antibiotikaresistens. Den ökande förekomsten av multi-resistenta mikroorganismer utgör ett stort hot. Kursen inriktar sig på grundläggande frågeställningar rörande antibiotika. Vilken bAntibiotics are very important compounds. The majority of all known antibiotics are produced by bacteria. Antibiotics were once regarded as miracle drugs. However, they are becoming less effective as bacteria develop resistance against them. The increasing occurrence of micro-organisms that are resistant to multiple antibiotics constitutes a serious threat to human health. The course addresses fun

Neurobiologi är ett internationellt stort forskningsområde på gränsen mellan biologisk grundforskning och medicinskt tillämpning. Vår kurs ger en introduktion i ämnet som du kan bygga på med andra mer specialiserade kurser, ett eget examensarbete, egen forskning eller ett jobb i ett av de stora biomedicinska företagen. Samtidigt, även om du inte vill fortsätta i ämnet, så får du en gedigen överbliNeurobiology is an internationally important research field where biological basic research and medical research come very close. We teach an introductory course that will allow you to continue with more specialized courses, a degree project and start your own research or get a position in one of the large biomedical companies. At the same time, if you do not want to specialize in this field, the

Bakterier utgör grunden för biosfären och är en förutsättning för allt liv på jorden. Denna kurs ger insikter i hur gener är organiserade och reglerade i bakterier och deras virus. Kursen omfattar molekylärbiologiska aspekter av gener, proteiner, proteinkomplex och andra biomolekyler som ger struktur och upprätthåller organismens funktioner. Användningen av genteknik och moderna tekniker såsom ”trBacteria make up the foundation of the biosphere and sustain all life on earth. This course provides insights into how genes are organised and regulated in bacteria and in their viruses. The course comprises molecular biology of genes, proteins, multicomponent protein complexes, and other biomolecules that provide structure and perform the organism’s functions. The use of genetic engineering and m